Dans la région nord, le long du littoral et du sous-littoral, plus précisément dans la région de la pointe Covarrubias, à l'embouchure de la baie de Malagueta, la végétation naturelle est surtout composée de microphyles et d'arbres à feuilles persistantes.
Les activités de l'homme ont affecté la flore sauvage; on peut toutefois y rencontrer dans la région côtière des forêts de semi-decidus et de mesophyles typiques associés à la végétation du manglar (arbre caractéristique de Cuba). Un exemple de ce type de végétation est la Copercicia rigide que l'on rencontre au sud de la baie de Malagueta.
Du centre à l'est de la région, prédomine une végétation reliée à la culture. On y rencontre aussi des pâturages alternant avec des plaines sauvages de végétation de type secondaire. La flore sauvage demeure liée aux zones désertiques même si l'inventaire des espèces endémiques est considérablement appauvri.
Au sud, sauf sur la bande du littoral qui est couverte de manglares touffus, on y rencontre une végétation défôrestée. La végétation semi-naturelle apparaît sous forme de fôrets de semi-decidus, mésophyles dont l'humidité de l'environnement fluctue. La flore sauvage est associée aux manglares et aux marécages du littoral.